Sistēmas ventilācija jāveic ļoti uzmanīgi. Pirmkārt, ir jāatbrīvojas no fermentācijas gāzes septiskajās tvertnēs, un, otrkārt, ir jānodrošina pareiza Biorock attīrīšanas iekārtas ventilācija.
BIOROCK instrukcijās norādītais diametrs ir 100 mm. Tas ir Eiropas standarts, un no šī viedokļa BIOROCK sistēma ir izturējusi sākotnējos sertifikācijas testus un darbojas citās valstīs.
Apvienotajā Karalistē plaši izmantotais 110 mm diametrs ir minimums. Lai veiktu nepieciešamos piesardzības pasākumus, tāpat kā uzstādot jebkādu sanitārijas ventilācijas sistēmu, nedrīkst būt 90° liekumi. Sistēma lieliski darbosies ar 45° liekumiem bez paaugstinājumiem. Septiskās tvertnes ieplūdes līniju diametram jābūt vismaz vienādam ar ēkas notekūdeņu izplūdes atveres diametru.